Церковь была закрыта в 1932 году. В ней находились ясли, позже мастерская по шитью лодок, а еще позже клуб. При этом была уничтожена глава церкви. Храм возвращен приходу и восстановлен в 1999 году. Второй престол церкви посвящен преподобным Зосиме и Савватию, Соловецким чудотворцам.

Церковь св.Афанасия на фото В.Н.Плотникова (конец XIX - начало ХХ в..)

В храме проводятся регулярные богослужения. Входит в Успенский комплекс наряду с Успенской церковью и колокольней.